More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1545 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 
400 aa  825    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 
400 aa  825    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  56.5 
 
 
400 aa  486  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.29 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.86 
 
 
404 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.2 
 
 
397 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.65 
 
 
402 aa  278  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.95 
 
 
397 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.95 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.89 
 
 
404 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.29 
 
 
397 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.9 
 
 
397 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.15 
 
 
397 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.15 
 
 
397 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.15 
 
 
397 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.15 
 
 
397 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.15 
 
 
397 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.8 
 
 
402 aa  262  6e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.59 
 
 
397 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.64 
 
 
403 aa  252  9.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35.44 
 
 
401 aa  242  7.999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.32 
 
 
398 aa  226  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.67 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  32.75 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  32.75 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 
459 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  45.06 
 
 
448 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  33.1 
 
 
448 aa  189  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  47.21 
 
 
394 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  41.46 
 
 
410 aa  186  6e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  36.53 
 
 
434 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  42.18 
 
 
436 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  42.72 
 
 
451 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  42.18 
 
 
436 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  42.18 
 
 
436 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  44.62 
 
 
407 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.63 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 
450 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 
465 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 
484 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
473 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
492 aa  160  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  37.74 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  37.74 
 
 
410 aa  154  4e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
584 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
454 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  39.7 
 
 
490 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  28.01 
 
 
420 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
442 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  38.5 
 
 
392 aa  142  9e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  36.12 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.79 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
583 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  34.18 
 
 
454 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0216  poly(A) polymerase I  34.18 
 
 
437 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000405641  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4310  polyA polymerase  34.41 
 
 
474 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0201  poly(A) polymerase I  34.18 
 
 
437 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000171206  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0200  poly(A) polymerase I  34.18 
 
 
437 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000820079  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0212  poly(A) polymerase I  34.18 
 
 
437 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00291988  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  39.61 
 
 
483 aa  136  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  36.32 
 
 
462 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 
490 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4014  poly(A) polymerase  32.34 
 
 
484 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0546071  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0736  poly(A) polymerase  37.56 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  34.82 
 
 
491 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6049  poly(A) polymerase  35.38 
 
 
495 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694866  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.09 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  33.21 
 
 
417 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  36.45 
 
 
391 aa  133  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  34.82 
 
 
467 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 
464 aa  133  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4562  poly(A) polymerase  35.87 
 
 
460 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4697  poly(A) polymerase  35.87 
 
 
460 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  hitchhiker  0.0000455164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  34.82 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  33.78 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3250  polyA polymerase  31.27 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  28.66 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.1 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62560  poly(A) polymerase  35.81 
 
 
467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0683  poly(A) polymerase I  33.2 
 
 
437 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000190798  normal  0.448758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5444  poly(A) polymerase  35.81 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3987  poly(A) polymerase I  33.47 
 
 
505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000599452  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2607  poly(A) polymerase (plasmid copy number protein)  32.49 
 
 
441 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000156252  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 
486 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  34.38 
 
 
455 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42690  polynucleotide adenylyltransferase; PcnB  33.79 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1618  poly(A) polymerase  33.62 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000408315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 
499 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  33.33 
 
 
443 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1131  poly(A) polymerase  33.33 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  23.86 
 
 
427 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  24.47 
 
 
423 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3590  poly(A) polymerase  33.94 
 
 
463 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.787264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  33.03 
 
 
423 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0696  poly(A) polymerase  31.38 
 
 
434 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000117677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  30 
 
 
457 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  39.59 
 
 
496 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3406  poly(A) polymerase  30.23 
 
 
435 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000031653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>