More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0756 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  100 
 
 
401 aa  825    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  47.59 
 
 
403 aa  355  6.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  45.77 
 
 
402 aa  333  3e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.03 
 
 
402 aa  316  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.77 
 
 
402 aa  316  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  45.36 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.65 
 
 
397 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.69 
 
 
397 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.37 
 
 
397 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.15 
 
 
397 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.19 
 
 
397 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.19 
 
 
397 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.19 
 
 
397 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.19 
 
 
397 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.87 
 
 
397 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.19 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  38.65 
 
 
399 aa  271  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.41 
 
 
397 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.3 
 
 
404 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.81 
 
 
404 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.44 
 
 
400 aa  242  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.44 
 
 
400 aa  242  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.57 
 
 
400 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  52.76 
 
 
448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  33.33 
 
 
422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  33.18 
 
 
424 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  50.5 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  47.73 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  46.38 
 
 
464 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  32.67 
 
 
451 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  34.5 
 
 
471 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  50.77 
 
 
407 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  34.02 
 
 
394 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  46.38 
 
 
434 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  43.81 
 
 
492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  48.56 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  43.08 
 
 
410 aa  181  2e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 
465 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  42.92 
 
 
436 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  42.79 
 
 
442 aa  169  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  43.06 
 
 
436 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  42.47 
 
 
436 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 
484 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
490 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  29.98 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.91 
 
 
464 aa  167  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.36 
 
 
486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  39.81 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.38 
 
 
583 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  46.19 
 
 
427 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  40.18 
 
 
552 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  40 
 
 
467 aa  156  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
454 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 
491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
584 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  39.91 
 
 
523 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  37.1 
 
 
409 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  30.66 
 
 
417 aa  150  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.55 
 
 
490 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  38.5 
 
 
483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  42.86 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.95 
 
 
487 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  30.73 
 
 
423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 
500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  31.33 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 
507 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
499 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  42.93 
 
 
475 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.18 
 
 
492 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.27 
 
 
483 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  41.26 
 
 
489 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.63 
 
 
473 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  39.3 
 
 
489 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  40.18 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  41.95 
 
 
480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  41.87 
 
 
382 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  39.55 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2050  poly(A) polymerase, PcnB  32.94 
 
 
462 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.187335 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  37.78 
 
 
423 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  39.36 
 
 
443 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.58 
 
 
485 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.38 
 
 
418 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
502 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  37.78 
 
 
423 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  28.9 
 
 
417 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  39.38 
 
 
386 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  38.91 
 
 
510 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1618  poly(A) polymerase  30.85 
 
 
455 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000408315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3250  polyA polymerase  32.35 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 
497 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  34.52 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  39.81 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4697  poly(A) polymerase  39.81 
 
 
460 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  hitchhiker  0.0000455164 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  40.78 
 
 
471 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0292  poly(A) polymerase  34.9 
 
 
454 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>