More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0908 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 
398 aa  816    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  49.24 
 
 
403 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.47 
 
 
402 aa  322  7e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43 
 
 
402 aa  320  3e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  45.36 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.75 
 
 
402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.61 
 
 
404 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.35 
 
 
404 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.35 
 
 
397 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.1 
 
 
397 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.35 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  41.69 
 
 
399 aa  272  6e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.9 
 
 
397 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.9 
 
 
397 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.9 
 
 
397 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.9 
 
 
397 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.15 
 
 
397 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.65 
 
 
397 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.4 
 
 
397 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39 
 
 
397 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.01 
 
 
400 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.32 
 
 
400 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.32 
 
 
400 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  34.07 
 
 
448 aa  222  7e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  52.86 
 
 
448 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  49.34 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  50.92 
 
 
459 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  36.04 
 
 
407 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  47.17 
 
 
424 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  46.7 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  41.44 
 
 
471 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  48.51 
 
 
436 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  48.51 
 
 
436 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  45.37 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  43.64 
 
 
473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  48.06 
 
 
436 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  47.67 
 
 
451 aa  182  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  47.57 
 
 
410 aa  182  9.000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  44.81 
 
 
394 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  44.39 
 
 
490 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
442 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.99 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  43.58 
 
 
484 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  43.63 
 
 
492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.4 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  42.27 
 
 
410 aa  159  6e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.01 
 
 
584 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
473 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 
525 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.13 
 
 
483 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 
499 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  32.6 
 
 
420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 
485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
486 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 
583 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  39.56 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  37.08 
 
 
523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  44.02 
 
 
427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  38.63 
 
 
475 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  36.55 
 
 
483 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  38.64 
 
 
423 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  38.5 
 
 
455 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  39.91 
 
 
510 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  37.83 
 
 
483 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1795  poly(A) polymerase  35.84 
 
 
439 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.649421  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  35.27 
 
 
471 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  38.64 
 
 
423 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.66 
 
 
491 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0390  poly(A) polymerase  35.84 
 
 
439 aa  143  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0179793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
492 aa  143  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3250  polyA polymerase  34.78 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.63 
 
 
502 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  38.46 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1390  poly(A) polymerase  38.64 
 
 
424 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  37.7 
 
 
488 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  38.79 
 
 
471 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  39.39 
 
 
489 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  37.09 
 
 
386 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2312  polyA polymerase  38.99 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.049056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.87 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3116  poly(A) polymerase I  31.8 
 
 
482 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.97 
 
 
428 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  33.08 
 
 
417 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  38.74 
 
 
417 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  36.75 
 
 
479 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3063  poly(A) polymerase  37.67 
 
 
473 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.3 
 
 
417 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1008  poly(A) polymerase I  38.28 
 
 
440 aa  136  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000170509  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0200  poly(A) polymerase I  37.33 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000820079  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  37.33 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3340  poly(A) polymerase I  38.28 
 
 
491 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.71757e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0201  poly(A) polymerase I  37.33 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000171206  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1162  poly(A) polymerase I  32.28 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000172758  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3470  poly(A) polymerase I  38.28 
 
 
491 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268944  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.24 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>