More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1689 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  100 
 
 
140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0880  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.577802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
293 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  31.3 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  32.69 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  32.69 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  32.69 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  32.54 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.33 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  34.21 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.67 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  31.73 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.67 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.67 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.67 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  30.77 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.67 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  31.67 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  32.52 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  30.43 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
206 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  29.84 
 
 
530 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 
396 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  35.51 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.78 
 
 
314 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  34 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  35.63 
 
 
314 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  33.06 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  36.78 
 
 
314 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  32.41 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  36.25 
 
 
383 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  30.65 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  32.17 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  35.63 
 
 
314 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  43.06 
 
 
316 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  36.45 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  30.97 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  27.5 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  29.81 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  32.43 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  33.33 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  33.05 
 
 
400 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  43.06 
 
 
316 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  27.5 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  28.85 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  38.89 
 
 
313 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  29.17 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
136 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  33.64 
 
 
138 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  33.64 
 
 
138 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
139 aa  52  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.41 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>