More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1448 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
430 aa  858    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  73.94 
 
 
258 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  60 
 
 
174 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  53.22 
 
 
205 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  59.71 
 
 
206 aa  172  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  58.27 
 
 
219 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  59.42 
 
 
182 aa  170  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  57.97 
 
 
203 aa  165  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  55.07 
 
 
158 aa  163  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  56.62 
 
 
182 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  56.62 
 
 
166 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  51.39 
 
 
160 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
272 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 
270 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  53.85 
 
 
169 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 
174 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  48.23 
 
 
282 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 
270 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 
270 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 
268 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  43.5 
 
 
302 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 
158 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  47.48 
 
 
248 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
151 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
141 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
150 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
149 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
142 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
147 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 
172 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
143 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
147 aa  78.2  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  32.28 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  32.28 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  32.28 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  32.28 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  27.74 
 
 
137 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 
137 aa  67  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  29.92 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34.31 
 
 
317 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
140 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
144 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3779  mutT/nudix family protein  27.74 
 
 
137 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
301 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
137 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3426  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  32.28 
 
 
137 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3712  mutT/nudix family protein  32.28 
 
 
137 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
153 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 
305 aa  59.7  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  29.93 
 
 
424 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  36.73 
 
 
156 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30 
 
 
140 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
129 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
150 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  40.26 
 
 
208 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
139 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
139 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
153 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
141 aa  57  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
322 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
142 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
208 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 
144 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 
149 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
298 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
305 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  30.51 
 
 
141 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
194 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  40 
 
 
195 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
139 aa  54.7  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
140 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
168 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
311 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
216 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
311 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
536 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
311 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  30 
 
 
155 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  39.36 
 
 
160 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  30 
 
 
155 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
299 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  30 
 
 
155 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
228 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
137 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
310 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  36.36 
 
 
142 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
148 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
180 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
211 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
155 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
230 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
146 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
171 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>