More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1417 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  100 
 
 
139 aa  283  5e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 
146 aa  135  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  47.48 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 
143 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
139 aa  120  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
140 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
144 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
142 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
583 aa  78.2  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  36.07 
 
 
313 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  32.48 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.57 
 
 
577 aa  62.4  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  31.85 
 
 
157 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  30.56 
 
 
203 aa  60.1  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
293 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
158 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  31.85 
 
 
430 aa  57.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  31.11 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 
219 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  29.63 
 
 
305 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  30.08 
 
 
258 aa  54.3  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  29.27 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  28.57 
 
 
314 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  30.43 
 
 
424 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  28 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
311 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
311 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
311 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
174 aa  50.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  30.37 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
303 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
237 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0193  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  29.1 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
302 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  29.1 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
229 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  28.24 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
314 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  37.11 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
343 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  28.29 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1651  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.73 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1399  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.373251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  23.88 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  49.09 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  30.56 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  29.92 
 
 
312 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  25 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
167 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>