267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0791 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 142 aa  293  7e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  45.83 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 583 aa  97.1  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.74 
 
 		 577 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  29.61 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 		 351 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  30.37 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  29.33 
 
 		 248 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 303 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 326 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  39.39 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 		 296 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1943  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.639742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  28.46 
 
 		 292 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  40.32 
 
 		 430 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  29.58 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  28.79 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 289 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 302 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 272 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 		 322 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.37 
 
 		 424 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 268 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  29.06 
 
 		 314 aa  47.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1748  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2155  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.028212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  48.84 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  48.84 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1604  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.83 
 
 		 315 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  29.2 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2469  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1595  hydrolase, NUDIX family  32.04 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000876504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1679  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.164244  normal  0.63188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1874  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00903017  hitchhiker  0.00000719314 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  32.04 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1297  NUDIX family hydrolase  32.04 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  26.87 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  24.22 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2477  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000509657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  29.51 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>