196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0260 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  100 
 
 
303 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  52.16 
 
 
325 aa  288  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  50.5 
 
 
333 aa  269  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  48.91 
 
 
292 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
310 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  45.58 
 
 
299 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  48.64 
 
 
303 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  44.84 
 
 
311 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  44.84 
 
 
311 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  44.48 
 
 
311 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.45 
 
 
315 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  42.01 
 
 
317 aa  191  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  45.39 
 
 
322 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  40 
 
 
305 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 
301 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
289 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  40.46 
 
 
314 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.54 
 
 
308 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
314 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  39 
 
 
322 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
326 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
324 aa  159  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
286 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 
336 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  38.25 
 
 
301 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  35.31 
 
 
351 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  36.75 
 
 
343 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  34.46 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
356 aa  132  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  35.69 
 
 
341 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  26.32 
 
 
398 aa  94  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 
139 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
140 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
138 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
136 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
151 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
164 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
149 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
145 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.37 
 
 
134 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
146 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  29.03 
 
 
142 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
139 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
229 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
142 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
150 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
174 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  32.65 
 
 
169 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
153 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
194 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
143 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
174 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  37.39 
 
 
424 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
129 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
136 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
154 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
139 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
139 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  29.29 
 
 
208 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  27.72 
 
 
164 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  27.72 
 
 
164 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
138 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  38.37 
 
 
160 aa  49.7  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
137 aa  49.3  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  27.64 
 
 
159 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
144 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.58 
 
 
577 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  26.21 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  27.88 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
163 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
165 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
151 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
141 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
148 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  29.85 
 
 
162 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
147 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
272 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  46.15 
 
 
149 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  35.87 
 
 
172 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
153 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
144 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 
583 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  28.32 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 
169 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>