216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4065 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1399  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.373251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  36.29 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  35.2 
 
 		 365 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  35.2 
 
 		 365 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  34.85 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  31.85 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  34.33 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  36.07 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  34.07 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  33.85 
 
 		 383 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  34.23 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  34.23 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  34.23 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  48.33 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  48.33 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  48.33 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  48.33 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  64.52 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  48.33 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  31.53 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  31.43 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  30.63 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  29.73 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  29.71 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  29.71 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  30 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  29.86 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  31.69 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  31.45 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2899  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  30.22 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  45 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  30.66 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  28.99 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 233 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  21.85 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  30 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  30 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  24.64 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  29.87 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  28.71 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3349  MutT/nudix family protein  28.42 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  28.44 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  41.51 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.25 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>