98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2947 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 127 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  56.1 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  45.53 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  44.72 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  45.53 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  45.53 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  45.53 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  45.53 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  45.53 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  44.72 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  43.65 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  45.08 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  44.26 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  42.02 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  44.54 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  44.26 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  41.8 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  43.7 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  40.91 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  43.22 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 163 aa  87.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  42.02 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  44.54 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  42.62 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 173 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  42.02 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  36.89 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  40.5 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  41.32 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  41.8 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 192 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.82 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  27.19 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.04 
 
 		 365 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  27.19 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  26.32 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  27.19 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2848  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 145 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 145 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  32.17 
 
 		 365 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  32.17 
 
 		 365 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  27.19 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  25.44 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 		 146 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>