106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1596 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  79.59 
 
 		 152 aa  253  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  62.5 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  61.97 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  63.89 
 
 		 192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  62.5 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  62.5 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  62.5 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  61.81 
 
 		 164 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  63.19 
 
 		 171 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  63.38 
 
 		 162 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  61.97 
 
 		 163 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  61.81 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  61.81 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  61.97 
 
 		 161 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  61.27 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 164 aa  173  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  63.19 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  61.81 
 
 		 158 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 170 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  59.31 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  57.04 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 156 aa  147  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  53.47 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  54.42 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 174 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  54.93 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  51.41 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 		 161 aa  126  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  46.04 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  46.43 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  43.57 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  43.57 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  44.29 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  44.29 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  44.29 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  44.29 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  44.29 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  44.29 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  43.57 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  42.14 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  42.14 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  42.14 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  42.14 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  42.14 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  44.35 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.96 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  34.03 
 
 		 365 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  30.77 
 
 		 365 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  30.77 
 
 		 365 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  30.95 
 
 		 383 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  29.93 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  32.87 
 
 		 315 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  29.25 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26314  predicted protein  42 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1297  NUDIX family hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2469  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1991  NUDIX family hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1312  hydrolase, NUDIX family  34.52 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.869507  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  34.52 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1595  hydrolase, NUDIX family  34.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000876504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01132  bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/ thiamin pyrophosphate hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01140  hypothetical protein  34.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 158 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>