111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0631 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
150 aa  309  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  62.24 
 
 
148 aa  184  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  55.92 
 
 
192 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  60.27 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  59.21 
 
 
158 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  60.84 
 
 
161 aa  169  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  59.44 
 
 
161 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  56.29 
 
 
171 aa  167  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  57.53 
 
 
163 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  57.78 
 
 
157 aa  164  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  56.85 
 
 
157 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  54.61 
 
 
154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  54.79 
 
 
146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  53.29 
 
 
158 aa  159  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  58.27 
 
 
162 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  58.04 
 
 
173 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  52.63 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  52.63 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  52.63 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  52.63 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  52.63 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  52.63 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  51.97 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  53.47 
 
 
170 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  53.74 
 
 
164 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  52.03 
 
 
164 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  48.63 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  53.42 
 
 
163 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  52.03 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  52.03 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  52.03 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  50 
 
 
170 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  50 
 
 
164 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  50.7 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  52.48 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 
174 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  47.41 
 
 
148 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 
161 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  47.1 
 
 
147 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  47.83 
 
 
150 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  47.1 
 
 
169 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  47.1 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  47.1 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  46.38 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  44.93 
 
 
154 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 
148 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  43.22 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  39.86 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  33.08 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1943  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.639742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  27.63 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  26.35 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  26.35 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  34.21 
 
 
383 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  26.53 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2155  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.028212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  26.85 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  28.81 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1870  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0662124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  25.17 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  25.17 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  25.17 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  39.06 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  39.06 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2899  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
153 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
150 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.23 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
265 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.23 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
293 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  31.3 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>