155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01728 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 146 aa  302  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  56.1 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  46.85 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  46.85 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  46.85 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  47.26 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  47.55 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  49.29 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  46.81 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 169 aa  123  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  46.38 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  48.94 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 160 aa  119  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  44.06 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  44.76 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  46.1 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  43.62 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  43.15 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  44.06 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 173 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  44.68 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  48.94 
 
 		 163 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  46.26 
 
 		 161 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  44.08 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  45.83 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  43.97 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  42.25 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  41.84 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  43.26 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  43.26 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  43.36 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  43.26 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  43.26 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  43.26 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  43.26 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  43.26 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  42.55 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  42.55 
 
 		 164 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  41.96 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  40.71 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  41.96 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  41.96 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  41.96 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  42.55 
 
 		 192 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.21 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.81 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.59 
 
 		 365 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.59 
 
 		 365 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  30.65 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  33.57 
 
 		 383 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  29.84 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  29.84 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  29.84 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  29.84 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  30.09 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  26.21 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  45.45 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  25.85 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  34.62 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>