195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1372 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  53.55 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  53.64 
 
 		 200 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  48.73 
 
 		 184 aa  151  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 		 327 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 340 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  35.76 
 
 		 351 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  35.06 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 347 aa  87  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  36.04 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  28.28 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  26.71 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.16 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.55 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  35.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  35.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 305 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 315 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1196  mutator MutT protein  34.78 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  43.94 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0415  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  26.36 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1099  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  33.33 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000230167  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  40 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 456 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.8 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1856  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015208  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 133 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 361 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  22.83 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 525 aa  44.3  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>