237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4004 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 166 aa  320  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 		 327 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  44.3 
 
 		 351 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 347 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 347 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 341 aa  90.9  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 340 aa  84.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 174 aa  84  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 441 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 456 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  36.42 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  37.4 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  28.03 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  32.89 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  32.89 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  32.21 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  32.21 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  52.86 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  31.54 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  31.54 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  31.54 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  31.54 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.09 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 135 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 135 aa  50.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40.91 
 
 		 314 aa  50.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 305 aa  50.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 133 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  29.14 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.02 
 
 		 139 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  46.25 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  50.68 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 525 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  40.58 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>