230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2258 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  100 
 
 		 173 aa  346  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  69.51 
 
 		 193 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  68.94 
 
 		 162 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  72.33 
 
 		 168 aa  228  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  70.44 
 
 		 162 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  67.92 
 
 		 169 aa  220  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  69.38 
 
 		 162 aa  217  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  57.05 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  53.47 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  53.47 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  54.86 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  49.36 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  51.08 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  49.63 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  48.61 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  50.36 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  52.76 
 
 		 132 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  37.59 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  28.97 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.04 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  39.39 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 315 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  37.39 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 361 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 102 aa  47.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  52 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.23 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  28.23 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  26.77 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  41.56 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0230  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  30.22 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  29.09 
 
 		 524 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  35.63 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  37.21 
 
 		 129 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.91 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  38.03 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2138  MutT/NUDIX family mutator protein  32.29 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>