More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4504 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  100 
 
 
134 aa  277  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  70.15 
 
 
134 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  68.89 
 
 
135 aa  188  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  66.67 
 
 
135 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  64.83 
 
 
145 aa  185  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  64.83 
 
 
145 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  62.25 
 
 
151 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  65.93 
 
 
135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  61.04 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  65.93 
 
 
135 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  64.93 
 
 
133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  61.38 
 
 
145 aa  180  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  64.96 
 
 
137 aa  180  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  61.19 
 
 
133 aa  174  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  34.53 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  31.15 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  36.78 
 
 
530 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  31.15 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  40 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  48.48 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  48.48 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
229 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  44.59 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  46.3 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  35.24 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
340 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  44.44 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
222 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  43.33 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  32.31 
 
 
212 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  31.58 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  32.32 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  44.26 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  32.32 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  34.88 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  38.81 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  32.32 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4746  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
168 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  31.91 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
253 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  26.28 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  27.01 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  27.01 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  41.33 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  32.32 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  32.65 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>