More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0467 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  100 
 
 
135 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  99.26 
 
 
135 aa  279  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  94.81 
 
 
135 aa  269  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  92.59 
 
 
135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  78.62 
 
 
145 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  78.62 
 
 
145 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  79.31 
 
 
145 aa  230  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  75.5 
 
 
151 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  74.03 
 
 
154 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  66.67 
 
 
133 aa  184  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  64.44 
 
 
133 aa  183  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  65.93 
 
 
134 aa  181  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  67.41 
 
 
134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  63.04 
 
 
137 aa  177  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  40 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  37.5 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  37.5 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  36.9 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  36.56 
 
 
169 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  35 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  36.9 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  35 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  35 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  35 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  35 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  35 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  35 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  45 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  34.17 
 
 
229 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  32.37 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  40.74 
 
 
530 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  34.17 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  38.27 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  38.54 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  38.54 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  42.42 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  42.42 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  40.23 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  40.91 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  37.89 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  35.42 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  27.97 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  44 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  45.31 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  35.8 
 
 
255 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  44 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  37.36 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4746  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  45.31 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  38.82 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  34.62 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  37.21 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  40.68 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  30.91 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  29.55 
 
 
181 aa  53.5  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5035  mutT/nudix family protein  31.36 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.24 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4795  mutT/nudix family protein  31.36 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4636  Nudix hydrolase  31.36 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  29.91 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>