More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6876 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  100 
 
 
175 aa  350  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 
282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
156 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 
167 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
230 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
218 aa  97.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  46.6 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  42.18 
 
 
163 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  37.96 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  39.71 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  35.48 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  34.26 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
130 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
140 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
140 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
135 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 
229 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
135 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
145 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
142 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
135 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
154 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
151 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  33.65 
 
 
135 aa  52  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  41.07 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  30.28 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
153 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  37.31 
 
 
159 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
164 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  30.28 
 
 
164 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
145 aa  50.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
164 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  37.31 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  34.52 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  29.36 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
134 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  63.16 
 
 
313 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3288  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.549331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
135 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  31.86 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  43.1 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
137 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
299 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
134 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
305 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
252 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  25.79 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
137 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  34.62 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  45 
 
 
347 aa  48.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.74 
 
 
312 aa  48.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
171 aa  47.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
237 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>