More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0862 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
147 aa  303  6e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0122  NUDIX hydrolase  48.61 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.151364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1456  MutT/nudix family protein  46.38 
 
 
154 aa  138  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000100507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1861  mutT/nudix family protein  33.08 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01503e-50 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1888  mutT/nudix family protein  33.08 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1681  mutT/nudix family protein  34.15 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000627508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1816  mutT/nudix family protein  34.15 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000181059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1627  MutT/Nudix family protein  33.08 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000898193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1662  MutT/Nudix family protein  33.08 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.824241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1937  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0285  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1826  phosphohydrolase  32.79 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007106  pE33L80004  phosphohydrolase, MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  38.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1680  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3516  phosphohydrolase  31.67 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  37.86 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  37.86 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.91 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0623  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
167 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
150 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4311  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
173 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317072  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
171 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06139  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  35.16 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  34.34 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01027  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  35.16 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  35.87 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0065  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.783309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 
286 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  29.6 
 
 
130 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
171 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  35.87 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  35.87 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  35.87 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3567  hypothetical protein  29.45 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.76977  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  33.7 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  30.4 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  31.58 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  40.86 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  30 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  32.14 
 
 
130 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
154 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  28.44 
 
 
147 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
146 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  31.25 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  31 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0415  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  25 
 
 
322 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1041  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.317547  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1920  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  26.32 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  31.3 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  27.82 
 
 
303 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  29 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2259  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  26.92 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  28.85 
 
 
329 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.75 
 
 
135 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  30.97 
 
 
158 aa  48.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  29.17 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>