More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0963 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  100 
 
 
139 aa  273  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  47.58 
 
 
152 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  41.13 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  41.13 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  46.53 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.59 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  39.5 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  39.5 
 
 
473 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  37.69 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  46.81 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  46.81 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  46.81 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  43.75 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  67.39 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
196 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  32.03 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.86 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.86 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.86 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
163 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  31.97 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.23 
 
 
346 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
153 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.77 
 
 
345 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.23 
 
 
346 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  35.04 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
236 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
199 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  32.48 
 
 
329 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  33.61 
 
 
347 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  32.48 
 
 
329 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  30 
 
 
171 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  53.12 
 
 
224 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  31.97 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33.64 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  31.97 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33.64 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.77 
 
 
346 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.77 
 
 
346 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
171 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.88 
 
 
351 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.77 
 
 
346 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  30.33 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.77 
 
 
346 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.04 
 
 
345 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 
251 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>