More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3984 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  76.16 
 
 		 159 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  70.89 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  75.35 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 		 196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  53.79 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 		 146 aa  98.2  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 149 aa  94.4  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 144 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 147 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  40.31 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  38.97 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  42.45 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  42.45 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  42.45 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  43.69 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  36.88 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  36.17 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  40 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.59 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  46.55 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  37.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  37.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  37.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  36.88 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  37.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  34.02 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  32.06 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  34.53 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  36.7 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.41 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.09 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.09 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  43.24 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>