More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1980 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  94.38 
 
 		 162 aa  296  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  87.16 
 
 		 163 aa  254  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  75.5 
 
 		 161 aa  221  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 		 146 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  41.38 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  41.38 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  41.38 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  41.61 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 143 aa  96.3  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 146 aa  94.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3067  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  44.64 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  35.38 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  35.38 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  36.54 
 
 		 473 aa  64.3  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  34.62 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  31.69 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  37.25 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  31.03 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  31.03 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  33.64 
 
 		 352 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 135 aa  62  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  32.58 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  34.07 
 
 		 358 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  32.14 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  32.58 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  29.31 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  34.55 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  32.38 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  32.38 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  33.66 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.45 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  29.1 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  31.78 
 
 		 352 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.4 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2419  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.217512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  36.17 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  32.31 
 
 		 347 aa  57.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  30.17 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>