More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3935 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  346  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 		 134 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 141 aa  104  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  40.13 
 
 		 139 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 146 aa  91.3  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 126 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 136 aa  85.1  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  36.42 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  41.96 
 
 		 473 aa  74.3  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  37.31 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  37.31 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  37.31 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  35.4 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  36.23 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  29.85 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  54.43 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  45.33 
 
 		 224 aa  62  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 152 aa  62  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  32.58 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  41.46 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  45.07 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  45.07 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  45.07 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  58.33 
 
 		 570 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  43.66 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  43.66 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 340 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  43.66 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  37.04 
 
 		 351 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  43.28 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  42.25 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  34.57 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  25.52 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>