More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1477 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 158 aa  319  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 158 aa  319  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 158 aa  319  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  84.66 
 
 		 163 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  45.77 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  39.55 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3067  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  35.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  35.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  35.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  35.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  34.33 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  33.06 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.6 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  41.94 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  39.13 
 
 		 358 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  37.38 
 
 		 400 aa  63.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  40.82 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  40.82 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  34.68 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  33.07 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  29.71 
 
 		 399 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  39.81 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.02 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  31.21 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.33 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>