More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1522 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  100 
 
 
137 aa  283  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 
133 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  59.85 
 
 
140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  55.15 
 
 
150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1227  NUDIX hydrolase  51.49 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.756044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  40 
 
 
226 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
136 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  28.7 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
180 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  36.28 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  33.91 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  27.07 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  36.36 
 
 
248 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
200 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  34.15 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
268 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
282 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  35 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  35 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  35 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  28.45 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  35 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  35 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
165 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  35.94 
 
 
314 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  35 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
270 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
270 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.63 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  27.59 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  33.75 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  28.45 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 
236 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
272 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
299 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  27.59 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
270 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
260 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
208 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.02 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  33.66 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.02 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.02 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>