More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4127 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 134 aa  84  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  40.95 
 
 		 315 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  29.03 
 
 		 570 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  50.77 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  32.35 
 
 		 337 aa  58.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  46.75 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  45.45 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  47.69 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  31.82 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  24.6 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  47.69 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  50 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  30.97 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  30.09 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  33.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  34.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  35.29 
 
 		 317 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.29 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.29 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  45 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  33.03 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  34.48 
 
 		 318 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.99 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.99 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.99 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  36.76 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.27 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  29.84 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 132 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.75 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  28.83 
 
 		 136 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 196 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 229 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  33.65 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  30.83 
 
 		 128 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1681  mutT/nudix family protein  35.96 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000627508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  30.63 
 
 		 128 aa  51.2  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  29.52 
 
 		 136 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.15 
 
 		 346 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1816  mutT/nudix family protein  35.96 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000181059  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  29.52 
 
 		 136 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  35.53 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1861  mutT/nudix family protein  35.96 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01503e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1937  mutT/nudix family protein  32.76 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  45.71 
 
 		 314 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  34.21 
 
 		 325 aa  50.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  34.12 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  34.12 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 136 aa  50.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  49.06 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  49.06 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.04 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  49.06 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>