More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2716 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  78.95 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  53.17 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  50.79 
 
 		 136 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  45.22 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  43.65 
 
 		 337 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  45.99 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  43.52 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  43.52 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  42.59 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  41.18 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  38.05 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  36.44 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  36.44 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  36.44 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  34.4 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  33.08 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  36.7 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  32.14 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  32.71 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  31.62 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1681  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000627508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1816  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000181059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1861  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01503e-50 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  31.86 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  36.78 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  30.09 
 
 		 363 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  30.97 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.84 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  30.97 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.04 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  31.3 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  29.82 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  35.4 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1937  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>