More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3967 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 165 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  40.38 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  35.58 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 203 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3038  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 174 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  31.03 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.65 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  30.83 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  40.62 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  33.98 
 
 		 301 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  34.68 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  31.37 
 
 		 758 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 238 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 238 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  34.88 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  32.5 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  32.5 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  27.88 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.96 
 
 		 570 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1870  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0662124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2155  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.028212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 289 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  28.85 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  28.85 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.7 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  28.85 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  43.14 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  39.39 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  50 
 
 		 322 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  39.39 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>