More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6153 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  100 
 
 
185 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  95.14 
 
 
185 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  95.14 
 
 
185 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  78.85 
 
 
183 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  47.45 
 
 
141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  47.45 
 
 
141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
140 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
141 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
141 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  54.78 
 
 
140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 
140 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 
140 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  56.07 
 
 
758 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  42.65 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
142 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
142 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 
122 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  48.67 
 
 
137 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
165 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 
135 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  43.22 
 
 
128 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
146 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 
140 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 
132 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
124 aa  84.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  47.41 
 
 
132 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  38.46 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  40.78 
 
 
132 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
154 aa  55.5  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
167 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
153 aa  54.3  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
162 aa  54.3  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
284 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
161 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 
153 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  32.17 
 
 
310 aa  51.2  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
260 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  37 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  43.55 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  43.55 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  35.87 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  43.55 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  28.89 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  43.86 
 
 
143 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  31.45 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
146 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  48 
 
 
149 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  33.59 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  54.76 
 
 
148 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
162 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  48.98 
 
 
161 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  43.55 
 
 
147 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  48.98 
 
 
161 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  34.68 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 
149 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
134 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  43.55 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  34.68 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  32.77 
 
 
473 aa  48.5  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  34.68 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  30.65 
 
 
147 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  31.75 
 
 
153 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
136 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  28.89 
 
 
147 aa  48.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
149 aa  47.8  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
136 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  35.48 
 
 
141 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
254 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  48 
 
 
320 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
258 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>