293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5533 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  53.97 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 203 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  44.86 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  51.46 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  43.69 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  42 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  38.89 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  34.82 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  32.63 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  55.1 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  34.62 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  38.27 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  38.27 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  38.27 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.86 
 
 		 305 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  38.27 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 230 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  36.14 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  36.14 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  38.2 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  36.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  38.2 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  36.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  38.2 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  36.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  36.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  38.2 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  36.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  36.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  37.7 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  37.7 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  47.17 
 
 		 315 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  38.2 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  32.41 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 157 aa  48.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  35.11 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  29.91 
 
 		 396 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  47.27 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  38.75 
 
 		 758 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  35.96 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.94 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  33.33 
 
 		 524 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  34.48 
 
 		 399 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>