273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4759 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  100 
 
 
203 aa  420  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  53.45 
 
 
158 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  50 
 
 
146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 
141 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 
141 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 
141 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  47.32 
 
 
128 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 
140 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 
147 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  47.32 
 
 
140 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 
140 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 
165 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 
142 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
142 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  50 
 
 
132 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  48.67 
 
 
132 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  46.02 
 
 
124 aa  98.2  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
141 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  48.42 
 
 
122 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
137 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  52.13 
 
 
135 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
183 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
185 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
185 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
185 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
120 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
140 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
130 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  37.5 
 
 
758 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 
146 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
149 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 
132 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  39.18 
 
 
132 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
136 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
153 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  34.45 
 
 
163 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
143 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
138 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
151 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
156 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  50 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  36.14 
 
 
136 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
208 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
161 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  47.46 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  47.46 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  47.46 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  47.46 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  47.46 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
136 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
161 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  35.64 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  32.76 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 
140 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
314 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  32.76 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 
139 aa  49.7  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  32.76 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  34.65 
 
 
140 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  50 
 
 
144 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  35.29 
 
 
105 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  34.65 
 
 
140 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  45.76 
 
 
147 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  35.42 
 
 
337 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  33.68 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
152 aa  48.5  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  31.09 
 
 
140 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
145 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
158 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
137 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 
320 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  44.07 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  32.63 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
303 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  34.65 
 
 
140 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
174 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  31.48 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
164 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 
153 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>