More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6546 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  95.14 
 
 		 185 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  80.13 
 
 		 183 aa  243  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 		 141 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 		 141 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  47.45 
 
 		 141 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  41.78 
 
 		 158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  55.65 
 
 		 140 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  53.91 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  57.01 
 
 		 758 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  53.91 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  53.91 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  49.56 
 
 		 137 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 165 aa  98.2  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 		 135 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  42.37 
 
 		 128 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 120 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 146 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 140 aa  87.8  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 132 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  47.41 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  39.56 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 132 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  40.78 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 284 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 167 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  28.89 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  43.86 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  43.55 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  43.55 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  43.55 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  48 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  31.11 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  28.89 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 258 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  48.98 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  43.55 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  48.98 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  31.11 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  54.76 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  31.85 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 257 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 147 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  32.17 
 
 		 310 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  34.75 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 473 aa  48.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  43.55 
 
 		 147 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  39.8 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 134 aa  47.8  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  34.23 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 136 aa  48.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 146 aa  47.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  27.35 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2018  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>