More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02246 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  30.25 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  29.32 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  27.61 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  28.68 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  27.69 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  44.16 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
167 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  34.41 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 
147 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
203 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  33.05 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  38.55 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  38.55 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  38.55 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  30.53 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2790  phosphohydrolase  30.58 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  31.65 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  48.15 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  32 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
141 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  28.46 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
141 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  38.38 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
282 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  30.58 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2593  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00926746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
149 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2781  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 
144 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.14 
 
 
159 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
140 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
161 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  42.31 
 
 
161 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  42.31 
 
 
161 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
130 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
149 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
161 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
185 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  46.55 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  46.55 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  32.03 
 
 
315 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  46.55 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
140 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  29.03 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1129  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  37.37 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
170 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 
293 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
340 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  37.18 
 
 
315 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  44.83 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  41.67 
 
 
314 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  44.83 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  44.83 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
190 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.52 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>