More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3407 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  290  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  97.14 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  83.57 
 
 		 141 aa  248  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  82.86 
 
 		 141 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  82.86 
 
 		 141 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  81.43 
 
 		 141 aa  234  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  62.93 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  60.16 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  60.16 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  60.16 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  58.68 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  59.83 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  60.53 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  51.26 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  53.78 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 		 183 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 185 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 185 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 185 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  45.38 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  47.32 
 
 		 203 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  40.54 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  40.34 
 
 		 758 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  37.29 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  47.54 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  31.75 
 
 		 430 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2721  mutT/nudix family protein  31.16 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00212915  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  26.77 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 185 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  30.16 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  30.16 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  30.47 
 
 		 172 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  30.39 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  46.67 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  46.67 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  46.67 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  31 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  26.77 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  28.99 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  28.99 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  48.33 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  37.8 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  29.8 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  28.99 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.09 
 
 		 258 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  28.99 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  34.57 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 197 aa  48.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  28.99 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>