More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4233 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  72.73 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  49.56 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  46.61 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  53.91 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  48.76 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 		 183 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  52.13 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  40.35 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  36.96 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  47.78 
 
 		 758 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  40 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  35.05 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  36.46 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  36.46 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  34.51 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  35.51 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  34.51 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  34.51 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  35.42 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  35.4 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  34.51 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  40.66 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  34.82 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  37.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  35.42 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  37.78 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  27.05 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  35.42 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  35.42 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  35.42 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  35.42 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  27.05 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  38.14 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 314 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  35.64 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  33.65 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  33.65 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3459  nucleoside triphosphatase YtkD  36.36 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.160983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  36.99 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  60.47 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.23 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  32.63 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>