167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4397 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  55.74 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  56.45 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  39.13 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  39.17 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  41.03 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.3 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  38.78 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  24.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  35.96 
 
 		 399 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  28.99 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  32 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  30.47 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  30.47 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  30.47 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  30.47 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  30.47 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  31.06 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  28.26 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  31.06 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  23.66 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  30.16 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  31.45 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  29.41 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  28.71 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2328  hypothetical protein  30.16 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  39.44 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  29.57 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  29.37 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  40 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  29.75 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  28.35 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  31.37 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  30.69 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  40.74 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>