291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1264 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  52.63 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  53.78 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  53.78 
 
 		 140 aa  139  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  55.46 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  55.46 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  53.78 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 		 203 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  53.91 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  49.14 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  52.21 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  44.54 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  49.57 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  50.96 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 185 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 185 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  58.21 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  42.86 
 
 		 758 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  34.68 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  35.79 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  27.83 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  33.58 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  27.83 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 160 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1148  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.180064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  39.06 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  32.99 
 
 		 140 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  39.06 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  39.06 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  31.58 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  31.16 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  29.57 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.18 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  34 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  24.41 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  37.78 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  39.06 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  39.06 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  35.94 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  29.59 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 291 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  35.94 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  29.84 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  31.11 
 
 		 434 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 320 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  32.99 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>