241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4549 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 144 aa  286  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  68.66 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  68.66 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  67.19 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  65.35 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  67.16 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  64.66 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  51.26 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  53.27 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  42.66 
 
 		 399 aa  103  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  45.31 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  46.77 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 398 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  45.04 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  46.23 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  46.36 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  46.36 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  39.64 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  36.84 
 
 		 354 aa  70.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  34.23 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  31.2 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  30.6 
 
 		 347 aa  50.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  28.81 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2577  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  27.68 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  32.61 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  31.48 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.37 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  30.16 
 
 		 314 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5146  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.17 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5053  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.17 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.98 
 
 		 314 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  27.42 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.17 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0319  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.17 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  31.5 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2328  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0427  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.94 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.751341  normal  0.0128679 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5285  mutT/nudix family protein  47.17 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4843  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.17 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48240  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.94 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007106  pE33L80004  phosphohydrolase, MutT/Nudix family protein  29.73 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  30.71 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5378  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.28 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290228  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  27.34 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0429  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.94 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>