59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3467 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  100 
 
 
130 aa  256  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  43.65 
 
 
133 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  44.96 
 
 
141 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 
140 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
132 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  44.19 
 
 
130 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
137 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
138 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  32.28 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  36.75 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  37.74 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  37.74 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  37.23 
 
 
399 aa  53.9  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
398 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
139 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  45.21 
 
 
354 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3159  mutT/nudix family protein  42.68 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  30 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  30.28 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.17 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0103  MutT/nudix family protein  29.6 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  41.67 
 
 
129 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
134 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  41.67 
 
 
129 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2328  hypothetical protein  29.36 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  51.06 
 
 
318 aa  40.8  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 
291 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  32.18 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  42.37 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  34.41 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>