More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3918 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 136 aa  270  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  84.33 
 
 		 136 aa  226  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  70.45 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  70.45 
 
 		 137 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  70.08 
 
 		 137 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  65.35 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  68.99 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  50.4 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  51.26 
 
 		 399 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  46.97 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  47.58 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 398 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  44.6 
 
 		 354 aa  88.6  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  47.66 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  47.66 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  50.41 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  43.2 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  34.17 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  40 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  40.2 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  44.44 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  35.19 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.5 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  50 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  47.83 
 
 		 314 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  50 
 
 		 315 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  47.83 
 
 		 314 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  35.78 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  35.82 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  37.27 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.09 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  34.74 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  33.86 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  44.87 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  33.86 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  34.86 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  46.38 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.65 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.5 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.51 
 
 		 473 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  34.65 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.59 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  33.09 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.59 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.09 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  33.61 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  36.25 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  48.33 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  31.15 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  29.63 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  40.85 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  30.71 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.07 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>