More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3290 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 120 aa  249  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  46.22 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 185 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 185 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 185 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  41.67 
 
 		 158 aa  90.1  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  45.63 
 
 		 132 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 183 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 203 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  44.17 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  37.17 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  30 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  44.26 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  30 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 		 473 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  34.26 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  45.31 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  45.31 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  45.31 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  47.69 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  30.51 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  43.75 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  43.75 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  37.66 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  34.52 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  31.73 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  36.96 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  36.96 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  36.96 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.68 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.68 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.68 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.98 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  27.91 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  27.05 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 216 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  30.48 
 
 		 758 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  32.56 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.68 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.68 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  47.27 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>