More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1563 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  100 
 
 
151 aa  312  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  100 
 
 
151 aa  312  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  91.39 
 
 
151 aa  290  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  59.6 
 
 
165 aa  183  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 
154 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  53.47 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 
162 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 
162 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
162 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  57.46 
 
 
132 aa  146  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  51.03 
 
 
159 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
158 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 
163 aa  143  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  52.21 
 
 
169 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 
168 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  48.61 
 
 
156 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 
175 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  49.31 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  49.65 
 
 
158 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 
175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
156 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
146 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  41.46 
 
 
160 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  29.93 
 
 
207 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  32.58 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  33.08 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  30.4 
 
 
204 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
170 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  34.69 
 
 
181 aa  57  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  30.37 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  31.34 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  33.61 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  29.85 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
146 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 
151 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.23 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  33.75 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  33.75 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  36.25 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
191 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  33.75 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  33.75 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  33.75 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  30 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  40 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  33.33 
 
 
524 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
212 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  31.82 
 
 
164 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
155 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  27.42 
 
 
137 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15110  NUDIX family protein  27.82 
 
 
153 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  29.75 
 
 
159 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  29.17 
 
 
159 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  36.49 
 
 
153 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  36.49 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  36.49 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  36.49 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>