More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2217 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  313  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  49.32 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 		 193 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  50.7 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  53.52 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  46.26 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  44.97 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  45.58 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  45.58 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  44.78 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  38.35 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 179 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.61 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  32.54 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1798  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  35.42 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0516  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  40.58 
 
 		 530 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  50.91 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  47.06 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  34.18 
 
 		 317 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  32 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0178  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  29.66 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  32.23 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  26.4 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15110  NUDIX family protein  35.71 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 456 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  25.86 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  37.31 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>