249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1383 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  77.5 
 
 		 168 aa  252  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  75.47 
 
 		 162 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  70.37 
 
 		 162 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  69.51 
 
 		 173 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  71.08 
 
 		 169 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  71.88 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  59.06 
 
 		 154 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  58.11 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 151 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  55.24 
 
 		 156 aa  147  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  50.34 
 
 		 151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  50.34 
 
 		 151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  47.7 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 		 159 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 158 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  53.62 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 156 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  50.76 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  53.54 
 
 		 132 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 146 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  35.07 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 135 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  32.81 
 
 		 133 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 130 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 135 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 133 aa  51.6  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 155 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 155 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 155 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 160 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 154 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 144 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  26.89 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  32.32 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  47.73 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  47.73 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  37.93 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  26.89 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.89 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  47.37 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.32 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.21 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  29.52 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2138  MutT/NUDIX family mutator protein  31.63 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 301 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  29.52 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>