196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3830 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 301 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  72.33 
 
 		 304 aa  407  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  47.39 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  54.29 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  40.62 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  31.27 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  37.25 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  31.58 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 158 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  50.94 
 
 		 329 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  50.94 
 
 		 329 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 166 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 161 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 136 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  40 
 
 		 153 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  34.35 
 
 		 138 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  46.27 
 
 		 149 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 156 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  53.06 
 
 		 144 aa  48.9  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  45.31 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.19 
 
 		 138 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 148 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.19 
 
 		 138 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.3 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  44.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  44.78 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.23 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  48.98 
 
 		 136 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  30.63 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  44.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  48.21 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  44.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  44.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  44.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 153 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  43.75 
 
 		 170 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  50.91 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  35.29 
 
 		 138 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 139 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 133 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 148 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  35.37 
 
 		 138 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  35.37 
 
 		 138 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  51.02 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  48.98 
 
 		 128 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 143 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 155 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  51.02 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 154 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 		 128 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 		 128 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  46.3 
 
 		 137 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 148 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 		 128 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 132 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 136 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.51 
 
 		 131 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.4 
 
 		 135 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0347  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase, putative  40.98 
 
 		 170 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.163328  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.14 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  38.81 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 151 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>