227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3542 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  320  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3273  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02247  hypothetical protein  36.88 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1924  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1876  MutT/Nudix family protein  30.56 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2071  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2102  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1886  MutT/Nudix family protein  30.56 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1920  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.234524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2170  mutT/nudix family protein  29.91 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003515  hypothetical protein  32.19 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.430687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2549  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.925567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3248  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00145388  normal  0.225138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2060  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0210595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2142  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1445  MutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1491  MutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0683  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0501  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1677  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0887736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  43.75 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  43.75 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3371  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  42.67 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  37.93 
 
 		 524 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  40.58 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  46.15 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  46.55 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  43.14 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  46.55 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  44.26 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  46.55 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  43.14 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  42.59 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 216 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 327 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0649  MutT/nudix family protein  35.25 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  48.28 
 
 		 347 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.82 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2785  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.82 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  41.33 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 327 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  43.14 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2310  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  43.1 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.17 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  45.61 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2123  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.67 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0183314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.16 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.16 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.16 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  45.45 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  45.9 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.16 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.16 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  43.1 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  42.86 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  34.69 
 
 		 258 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  22.3 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.76 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  23.74 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 334 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  40.74 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  41.94 
 
 		 220 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  41.18 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  23.29 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  22.6 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  43.21 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>