38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3371 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3371  NUDIX hydrolase  100 
 
 
141 aa  280  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3273  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2142  mutT/nudix family protein  32.28 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2170  mutT/nudix family protein  30.71 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2549  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.925567  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1920  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.234524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1876  MutT/Nudix family protein  30.4 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1924  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2071  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2102  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1886  MutT/Nudix family protein  30.4 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1677  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0887736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2060  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
148 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0210595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3248  mutT/nudix family protein  29.6 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00145388  normal  0.225138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1445  MutT/nudix family protein  35 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1491  MutT/nudix family protein  35 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  60 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2244  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000175605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  41.67 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  41.67 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 
536 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  36.25 
 
 
424 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4725  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  27.73 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  50 
 
 
179 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>