144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1878 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 176 aa  361  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  98.86 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  96.02 
 
 		 176 aa  348  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  91.48 
 
 		 176 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  77.27 
 
 		 180 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  77.84 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  77.27 
 
 		 176 aa  287  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  76.7 
 
 		 180 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  76.14 
 
 		 177 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  57.46 
 
 		 180 aa  214  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  56.25 
 
 		 173 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  59.09 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  57.06 
 
 		 172 aa  203  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  54.8 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  55.93 
 
 		 172 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  53.41 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  51.93 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  53.37 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  53.14 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 		 175 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  42.24 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  41.61 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  32.43 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26314  predicted protein  34.58 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 340 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  46.51 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  46.51 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  46.51 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  46.51 
 
 		 140 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  47.5 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  34.41 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  47.5 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  46.15 
 
 		 317 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  41.46 
 
 		 314 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0684  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  47.83 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  48.84 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 314 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0609  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1088  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.56 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  32.97 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1886  MutT/Nudix family protein  40 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0582  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.59 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  38.55 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2142  mutT/nudix family protein  38.33 
 
 		 148 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.04 
 
 		 325 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  30.25 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  34.48 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 237 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  33.73 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  41.3 
 
 		 305 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 179 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  47.83 
 
 		 147 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  47.83 
 
 		 147 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  33.73 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 221 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 147 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>