More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6003 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 314 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  55.59 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  48.4 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  50.54 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  50.54 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  50.18 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  49.13 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  48.56 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  46.53 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.39 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  41.28 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  43.57 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  42.91 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  47.16 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  39.79 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  39.25 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 303 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  42.31 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  41.86 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  38.52 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  33.63 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  31.25 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  36.13 
 
 		 343 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 149 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 180 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.35 
 
 		 134 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  27.4 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 138 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  32.32 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  28.24 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 161 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 144 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 142 aa  53.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  31.31 
 
 		 137 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  31.31 
 
 		 137 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 174 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  31.31 
 
 		 137 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  31.31 
 
 		 137 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 149 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 194 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.2 
 
 		 159 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  29 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47297  predicted protein  42.37 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  37.25 
 
 		 524 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 143 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  28.24 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.06 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 134 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 158 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  34.26 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 137 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 149 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 143 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 165 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  33.01 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 163 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 132 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 164 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 141 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 149 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 161 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 177 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  39.24 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>